При большом увеличении абсцессы состоят из скоплений преимущественно полиморфноядерных лейкоцитов, ядра многих из них сильно изменены (деформация, распад на глыбки, появление вакуолей), указывают на гликогенную или жировую их дистрофию. Среди лейкоцитов можно обнаружить распадающиеся эпителиальные клетки, обрывки соединительнотканных волокон, а иногда примесь эритроцитов. Между клеточными элементами просматривается нежнозернистая (или гомогенная) бледноокрашенная масса серозной жидкости. При специальной окраске в абсцессах можно обнаружить микробы. Все перечисленные составные части и образуют гной.
В окружающих абсцессы участках сосуды сильно расширены, наполнены кровью, местами встречаются кровоизлияния. Эпителии канальцев с явлениями зернистой или жировой дистрофии, а отдельные клетки в состоянии некроза. В просветах канальцев, а также между канальцами в интерстициальной соединительной ткани отмечают скопления гнойного экссудата (гнойная инфильтрация).
При длительном процессе в гнойном экссудате появляется много лимфоцитов (вместо нейтрофилов), а по периферии очагов нагноения— лимфоидные клетки, фибробласты и другие клеточные элементы формирующейся грануляционной ткани. Еще в более поздней стадии вокруг абсцессов развивается волокнистая соединительная ткань (инкапсуляция).
Макрокартина: в паренхиме коркового и мозгового слоев отдельные или многочисленные гнойные очажки различной величины (от булавочной головки и крупнее); в корковом слое — округло-овальной, а в мозговом — продолговатой формы. Они серо-желтого цвета и окружены красным ободком гиперемированной почечной ткани.
При снятии капсулы гнойнички могут вскрываться, выделяя на поверхность сметаноподобпый гной. Густо расположенные гнойнички сливаются в более крупные (с горошину, лесной орех), достигая иногда значительных размеров. Кроме гнойничков в паренхиме (особенно коркового слоя) заметны множественные мелкие кровоизлияния. При хронической форме воспаления вокруг гнойничков разрастается соединительнотканная капсула в форме бледно-серого пояска различной ширины.